Amazonia Alta
 La amazonía alta de Ecuador comprende alrededor de 131.000 km2, cubierta mayormente de exuberantes bosques húmedos tropicales con una elevada diversidad biológica y endemismo, en la cual se combinan especies amazónicas, especies andinas y especies únicas de las cordilleras subandinas del Kutukú y de la cordillera del Cóndor. Para varios científicos solamente la amazonía alta del sur de Ecuador (provincia de Zamora Chinchipe) puede tener la flora mas rica de cualquier área de tamaño similar dondequiera en el Neotrópico y casi con certeza una de las concentraciones más altas de especies de plantas vasculares aún desconocidas científicamente de la tierra.
En esta región habitan más de 540.000 personas de culturas indígenas y mestizas, generadoras de conocimientos y prácticas ancestrales vinculadas fuertemente con la selva y sus recursos.
En la amazonía sur, NCI ha enfocado sus esfuerzos en los ecosistemas comprendidos entre el Parque Nacional Podocarpus y la cordillera del Cóndor, apoyando a los pueblos indígenas Shuar en Yacuambi en sus iniciativas para lograr la legalización de sus territorios ancestrales y para el manejo ordenado de sus recursos naturales. También apoya al Ministerio del Ambiente de Ecuador en la delimitación del Patrimonio Forestal del Estado en la cuenca del río Mayo.
NCI además cuenta con oficinas en la ciudad amazónica de Zamora, donde desarrolla actividades de educación y gestión ambiental urbana.
Schulenberg, T. S., & K. Awbrey. 1997. The Cordillera del Condor region of Ecuador and Peru: a biological assessment. Conservation International RAP Working Papers No. 7, Washington, D. C.
David Neill. Curador del Missouri Botanical Garden.
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